오메가3는 지용성 성분으로 음식물과 함께 섭취해야 체내 흡수가 잘 된다. 따라서 식사량이 가장 많은 저녁 섭취 후 바로 먹는 것이 좋다. 이때 위장에 기름기가 가장 많다. 단, 아스피린 등 혈액응고억제제를 복용하고 있다면 오메가3 복용 전 전문가와 상담해야 한다. 오메가3는 혈전(피떡)을 용해시키는 작용을 하기 때문이다. 수술을 앞뒀을 때도 먹지 않는 것이 좋다.